Od 2007 roku GDDKiA realizuje projekty współfinansowane z funduszy unijnych w ramach Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko.
W ramach POIiŚ na realizację projektów drogowych GDDKiA wykorzysta prawie 40 mld zł. Jako największy beneficjent Programu może pochwalić się znaczącymi sukcesami.
Udział umów o dofinansowanie podpisanych przez GDDKiA w ogólnej liczbie umów podpisanych w ramach Programu wynosi jedynie 2% (ogólnie w ramach POIiŚ podpisano 1 350 Umów o Dofinansowaniu, podczas gdy GDDKiA podpisała ich 27). Ale już ujęcie wartościowe pokazuje jak istotny wpływ GDDKiA na realizację Programu. Dofinansowanie przyznane do 27 lipca 2011 roku w ramach POIiŚ przedsiębiorcom, samorządom, instytucjom kultury i sztuki, ochrony zdrowia, uczelniom wyższym i urzędom administracji publicznej wyniosło ponad 65 miliardów złotych, w tym GDDKiA uzyskała ponad 36 mld zł, co stanowi ponad 56% środków.
GDDKiA wyróżnia się również w dziedzinie refundacji. Od początku wdrażania Programu GDDKiA złożyła prawie 190 wniosków o płatność, na łączną kwotę wydatków kwalifikowanych ponad 16 mld zł. Centrum Unijnych Projektów Transportowych certyfikowało do chwili obecnej wydatki zadeklarowane w 145 wnioskach o płatność, na kwotę ponad 12,5 mld zł. Refundacje z Komisji Europejskiej wynoszą 8,8 mld zł, co stanowi 56% ogólnych refundacji w ramach całego programu POIiŚ (wynoszących 15,6 mld zł).